La Regione Marche, ai sensi della L.R. n°6/2007, ha affidato alla Unione Montana Alta Valle del Metauro la gestione dei seguenti siti Natura 2000
ZSC IT5310010 Alpe della Luna – Bocca Trabaria
Ente gestore U.M. Alta Valle del Metauro
ZSC IT5310017 Monte Nerone - Gola di Gorgo a Cerbara
ZPS IT5310030 Monte Nerone e Monti di Montiego
Enti gestori U.M. Alta Valle del Metauro, U.M. Catria e Nerone
ZSC IT5310012 Montecalvo in Foglia
ZPS IT5310025 Calanchi e praterie aride della media Valle del Foglia
Enti gestori Provincia Pesaro e Urbino, U.M. Alta Valle del Metauro, U.M. Montefeltro
ZSC IT5310016 - Gola del Furlo
ZPS IT5310029 - Furlo
Enti gestori Provincia Pesaro e Urbino, U.M. Alta Valle del Metauro, U.M. Catria e Nerone